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食品微生物细菌真菌分子鉴定
2014-09-30 11:33  点击:778
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扩增细菌细菌16S、gyrB、rpoB基因片段,各进行二个测序反应,以得到较为全面的种属特异性信息。

得到信息后,进行生物信息学比对,以确定细菌的种类,多数情况下可以精确到种,少数情况下也可以定位到属。

l真菌26S rDNA D1/D2区序列解析

     PCR扩增真菌26S rDNA D1/D2区片段,长度在500~600 bp左右,只需进行一个测序反应,即可得到26S rDNA D1/D2区序列信息。该方法尤为适合对酵母菌进行鉴定。

l真菌ITS区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2) 全序列解析

      PCR扩增真菌ITS区片段,长度在300~1,000 bp左右,依据PCR扩增片段的长度,进行一个或两个测序反应,即可得到ITS区全序列信息。

l真菌18S rDNA区(包括ITS1、5.8S rDNA、ITS2) 全序列解析

     PCR扩增真菌18S区片段,长度在1.5K左右,进行两个测序反应,即可得到18S区核心序列信息。

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